MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 41104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015562	TATT	2	8	263486	263493	25 %	75 %	0 %	0 %	333910147
6002	NC_015562	TCT	2	6	263524	263529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910147
6003	NC_015562	A	6	6	263617	263622	100 %	0 %	0 %	0 %	333910147
6004	NC_015562	CAAA	2	8	263640	263647	75 %	0 %	0 %	25 %	333910147
6005	NC_015562	TTA	2	6	263676	263681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910147
6006	NC_015562	GTTG	2	8	263808	263815	0 %	50 %	50 %	0 %	333910147
6007	NC_015562	GATATT	2	12	263848	263859	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333910147
6008	NC_015562	A	6	6	263905	263910	100 %	0 %	0 %	0 %	333910147
6009	NC_015562	TTA	2	6	263938	263943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910147
6010	NC_015562	TGA	2	6	263949	263954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910147
6011	NC_015562	TGG	2	6	263976	263981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910147
6012	NC_015562	GAA	2	6	264011	264016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910147
6013	NC_015562	GAA	2	6	264021	264026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910147
6014	NC_015562	TGA	2	6	264036	264041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910147
6015	NC_015562	GTT	2	6	264061	264066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910147
6016	NC_015562	GAA	2	6	264106	264111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910147
6017	NC_015562	A	7	7	264153	264159	100 %	0 %	0 %	0 %	333910148
6018	NC_015562	A	6	6	264250	264255	100 %	0 %	0 %	0 %	333910148
6019	NC_015562	TTG	2	6	264304	264309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910148
6020	NC_015562	ATT	2	6	264319	264324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910148
6021	NC_015562	A	6	6	264362	264367	100 %	0 %	0 %	0 %	333910148
6022	NC_015562	A	6	6	264390	264395	100 %	0 %	0 %	0 %	333910148
6023	NC_015562	GAG	2	6	264402	264407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910148
6024	NC_015562	ATTTA	2	10	264409	264418	40 %	60 %	0 %	0 %	333910148
6025	NC_015562	A	6	6	264470	264475	100 %	0 %	0 %	0 %	333910149
6026	NC_015562	A	6	6	264489	264494	100 %	0 %	0 %	0 %	333910149
6027	NC_015562	TGA	2	6	264504	264509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910149
6028	NC_015562	TTG	2	6	264512	264517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910149
6029	NC_015562	AT	3	6	264579	264584	50 %	50 %	0 %	0 %	333910149
6030	NC_015562	AAC	2	6	264684	264689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910149
6031	NC_015562	TTA	2	6	264990	264995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910150
6032	NC_015562	CAAC	2	8	265006	265013	50 %	0 %	0 %	50 %	333910150
6033	NC_015562	AT	3	6	265079	265084	50 %	50 %	0 %	0 %	333910150
6034	NC_015562	TAA	2	6	265096	265101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910150
6035	NC_015562	ACC	2	6	265173	265178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333910150
6036	NC_015562	ATT	2	6	265186	265191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910150
6037	NC_015562	CCA	2	6	265264	265269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333910150
6038	NC_015562	TCAATA	2	12	265300	265311	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333910150
6039	NC_015562	CT	3	6	265652	265657	0 %	50 %	0 %	50 %	333910150
6040	NC_015562	TCA	2	6	265675	265680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910150
6041	NC_015562	TCC	2	6	265716	265721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910150
6042	NC_015562	CAA	2	6	265730	265735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910150
6043	NC_015562	TTG	2	6	265736	265741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910150
6044	NC_015562	CTT	2	6	265754	265759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910150
6045	NC_015562	TC	3	6	265761	265766	0 %	50 %	0 %	50 %	333910150
6046	NC_015562	GCTCCA	2	12	265792	265803	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333910150
6047	NC_015562	T	6	6	265804	265809	0 %	100 %	0 %	0 %	333910150
6048	NC_015562	GCC	2	6	265852	265857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333910150
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6050	NC_015562	GGA	2	6	266481	266486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910151
6051	NC_015562	A	6	6	266490	266495	100 %	0 %	0 %	0 %	333910151
6052	NC_015562	TA	3	6	266529	266534	50 %	50 %	0 %	0 %	333910151
6053	NC_015562	AGA	2	6	266544	266549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910151
6054	NC_015562	A	6	6	266580	266585	100 %	0 %	0 %	0 %	333910151
6055	NC_015562	ATAAAA	2	12	266612	266623	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333910151
6056	NC_015562	A	6	6	266620	266625	100 %	0 %	0 %	0 %	333910151
6057	NC_015562	GTT	2	6	266626	266631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910151
6058	NC_015562	TAT	2	6	266634	266639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910151
6059	NC_015562	ACA	2	6	266641	266646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910151
6060	NC_015562	ATT	2	6	266668	266673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910151
6061	NC_015562	ACT	2	6	266692	266697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910151
6062	NC_015562	GTA	2	6	266722	266727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910151
6063	NC_015562	AGA	2	6	266739	266744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910151
6064	NC_015562	TTG	2	6	266750	266755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910151
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6068	NC_015562	GAAG	2	8	266827	266834	50 %	0 %	50 %	0 %	333910151
6069	NC_015562	GGTA	2	8	266838	266845	25 %	25 %	50 %	0 %	333910151
6070	NC_015562	ATA	2	6	266863	266868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910151
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6072	NC_015562	TCT	2	6	267181	267186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910152
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6074	NC_015562	AAT	3	9	267210	267218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910152
6075	NC_015562	CAAT	2	8	267289	267296	50 %	25 %	0 %	25 %	333910152
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6079	NC_015562	ATT	2	6	267529	267534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910152
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6082	NC_015562	TAA	2	6	267626	267631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910152
6083	NC_015562	TTC	2	6	267663	267668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910152
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6087	NC_015562	T	7	7	267833	267839	0 %	100 %	0 %	0 %	333910152
6088	NC_015562	TCT	2	6	267842	267847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910152
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6091	NC_015562	ATA	2	6	268031	268036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910153
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6094	NC_015562	A	6	6	268207	268212	100 %	0 %	0 %	0 %	333910153
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6098	NC_015562	CATCAA	2	12	268299	268310	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333910153
6099	NC_015562	TTA	2	6	268318	268323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910153
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6102	NC_015562	T	7	7	268488	268494	0 %	100 %	0 %	0 %	333910153
6103	NC_015562	CTG	2	6	268526	268531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910153
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6105	NC_015562	T	6	6	268567	268572	0 %	100 %	0 %	0 %	333910153
6106	NC_015562	T	6	6	268586	268591	0 %	100 %	0 %	0 %	333910153
6107	NC_015562	CTTG	2	8	268702	268709	0 %	50 %	25 %	25 %	333910153
6108	NC_015562	CT	4	8	268726	268733	0 %	50 %	0 %	50 %	333910153
6109	NC_015562	GTGTG	2	10	268740	268749	0 %	40 %	60 %	0 %	333910153
6110	NC_015562	T	6	6	269046	269051	0 %	100 %	0 %	0 %	333910154
6111	NC_015562	AAT	2	6	269053	269058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910154
6112	NC_015562	TTCCA	2	10	269103	269112	20 %	40 %	0 %	40 %	333910154
6113	NC_015562	AACTC	2	10	269158	269167	40 %	20 %	0 %	40 %	333910154
6114	NC_015562	CTC	3	9	269318	269326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910154
6115	NC_015562	GCA	2	6	269334	269339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910154
6116	NC_015562	CAT	2	6	269340	269345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910154
6117	NC_015562	TTG	2	6	269402	269407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910154
6118	NC_015562	TC	3	6	269409	269414	0 %	50 %	0 %	50 %	333910154
6119	NC_015562	AAG	2	6	269449	269454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910154
6120	NC_015562	TGC	2	6	269649	269654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910154
6121	NC_015562	AAT	2	6	269659	269664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910154
6122	NC_015562	TTA	2	6	269690	269695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910154
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6124	NC_015562	TGC	2	6	269733	269738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910154
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6496	NC_015562	CT	3	6	284528	284533	0 %	50 %	0 %	50 %	333910170
6497	NC_015562	GGA	2	6	284534	284539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910170
6498	NC_015562	CAG	3	9	284540	284548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910170
6499	NC_015562	TTGCA	2	10	284554	284563	20 %	40 %	20 %	20 %	333910170
6500	NC_015562	GATG	2	8	284596	284603	25 %	25 %	50 %	0 %	333910170

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